在高等教育宏观管理方而，从“合并、合作、共建、调整”转变到“巩团、深化、提高、发展”上来。当务之急是尽快推山已经全国人大原则通过的《民办教育促进法》，把民办高等学校从立法上作为“与公有高校一样是高等教育事业的重要组成部分”的地位明确下来，并与公办高校在贷款、用地、资助免税、招生、用人等方面享有同等的权力、待遇和优惠，同时鼓励高等学校的“国有民办”、“民办公助”等开拓创新的体制转变和改革，丰富高等教育办学体制类型，形成整体活力。

在高等教育微观管理方面，需转变高校内部行政管理职能，降低管理成本。第一，尽可能剥离非直接教育服务项目，促使其社会化，做到管理、服务分开，高校行政机构职能适度综合化，院系以教学、科研和师生业务管理为主而不要求与校级机构上下对口，以精简机构和人员。第二，推行高校管理人员、教师聘任制和全员合同制，破除职称、职务终身制，实行教师任期制，由身份管理向岗位管理转变；打破教师的单位、学校所有制，推行学校内部、学校之间、地区之间互聘制度，统筹配置教师资源，激活教师队伍。第三，建立与工作绩效挂钩的收入和分配制度，淡化教职工工资收入中的“职称职务”、“年功”比例，提高工资中教学授课的份额，鼓励更多的高水平教师多授课，总体上切实按照工作量、工作成效付给相应报酬，形成体现贡献的薪酬激励机制。