1956年党的八大后,党章规定基层党组织对本单位起领导作用,高校的领导体制也逐步发生变化。由于党政不分,以党代政行为普遍,高校校务委员会有名无实,校长的作用难以发挥。

除了“文化大革命”期间,中小学一直实行的是“校长负责制”,但不同时期中小学校校长负责制的内涵和具体形式各不相同。1952年3月18日,教育部颁布的《中学暂行规程(草案)》第29条规定:“校长和副校长由省、市人民政府任命(省辖市和县设立的中学校长由市、县人民政府提请省人民政府任命)。各级人民政府业务部门内所设立的中学的校长由主管业务部门任命,并报同级人民政府教育部门备案。”

1963年的中小学《条例》中特别强调了“各级党委必须加强对中小学教育的领导”,“要有计划地从各方面调派一批得力的党员干部到中小学去加强领导工作”。《全日制中学暂行工作条例(草案)》第34条和《全日制小学暂行工作条例(草案)》第41条均规定:“校长是学校行政负责人,在当地党委和主管的教育行政部门领导下,负责领导全校的工作”,在校长主要职责中均规定“贯彻党中央相同务院的教育方针,执行教育行政部门的指尔;领导教学工作,进行思想政治教育工作”。